Компания Яндекс является публичной компанией и торгуется на бирже NASDAQ под тикером YNDX. Управление компанией осуществляется ее советом директоров, который в свою очередь избирается общим собранием акционеров. Согласно последним отчетам о состоянии компании, крупнейшим акционером Яндекса является российская компания «Алигази», которой принадлежит 29,1% акций. Вторым по величине акционером является «Yandex N.V.» с долей в 18.9%. «Yandex N.V.» является дочерней компанией Яндекса и была создана для упрощения инвестирования в акции Яндекса со стороны иностранных инвесторов, чьи фонды не имеют возможности инвестировать в российские компании напрямую. Еще 51,9% акций Яндекса находится в свободном обращении. Поэтому можно сказать, что компания не принадлежит одному человеку или организации, но у нее есть крупнейший акционер и управление компанией происходит коллективно через общее собрание акционеров и совет директоров.