Данные пары слов отличаются друг от друга двумя фонемами. Первая пара слов "был" и "бил" отличается только одной фонемой, а именно звуком [ы] в слове "был" и звуком [и] в слове "бил". Фонетические символы в квадратных скобках обозначают звуки, а не буквы, поэтому следует помнить, что наличие одной и той же буквы в разных словах не всегда означает одинаковые звуки. В данном случае, буква "ы" в слове "был" обозначает звук [ы], который является гласным и не имеет точного аналога в русской письменности. Второе слово "бил" содержит букву "и", которая обозначает звук [и], который также является гласным, но в этом случае имеет точный аналог в русской письменности. Вторая пара слов "лысый" и "лисий" также отличается одной фонемой, а именно звуком [ы] в слове "лысый" и звуком [и] в слове "лисий". Здесь буква "ы" в слове "лысый" обозначает тот же звук [ы], который уже упоминался ранее, и является гласным. Буква "и" в слове "лисий" обозначает звук [и], который также является гласным звуком. Таким образом, в каждой из данных пар слов основное различие заключается в замене звука [ы] на звук [и]. Это означает, что произношение этих слов различается только в одном звуковом элементе, который может влиять на их смысл.